| Cell-free Generation of COPII-coated Procollagen I Carriers
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Author:
Date:
2017-11-20
[Abstract] The aim of this protocol is to generate COPII-coated procollagen I (PC1) carriers in a cell-free reaction. The COPII-coated PC1 carriers were reconstituted from donor membrane, cytosol, purified recombinant COPII proteins, and nucleotides. This protocol describes the preparation of donor membrane and cytosol, the assembly of the reaction, and the isolation and detection of reconstituted COPII-coated carriers. This cell-free reaction can be used to test conditions that stimulate or suppress the packaging of PC1 into COPII-coated carriers.
[摘要] 该协议的目的是在无细胞反应中产生COPII包被的前胶原I（PC1）载体。 COPII包被的PC1载体由供体膜，胞质溶胶，纯化的重组COPII蛋白和核苷酸重构。 该方案描述了供体膜和细胞溶胶的制备，反应的组装，以及复制的COPII包被的载体的分离和检测。 该无细胞反应可用于测试刺激或抑制PC1包装成COPII包被的载体的条件。
【背景】外壳蛋白复合体II（COPII）在从内质网（ER）途径到高尔基体的运输中起着至关重要的作用。来自ER的货物运输所需的基因在酵母的基因研究中被发现，并且借助于添加有纯化组分的无细胞囊泡萌芽反应来阐明囊泡出芽所需基因的蛋白质产物的精确作用（Novick 1981; Kaiser等人，1990; Barlowe等人，1994）。开发了类似的反应来检测COPII在培养的哺乳动物细胞中来自ER的货物运输中的作用（Kim等人，2005）。哺乳动物COPII包被的囊泡直径大约为80-100nm，似乎太小以至于不能容纳诸如刚性的300nm前胶原I（PC1）三股螺旋杆的大分泌性货物。尽管可能的尺寸差异，COPII对于包括PC1在内的大型货物的分泌是必不可少的（Boyadjiev等人，2006）。最近，我们报道了通过随机光学重建显微镜（STORM），相关光电子显微镜（CLEM）和活细胞成像（Gorur ...
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| Isolation and Analysis of Proteoglycans and Glycosaminoglycans from Archaeological Bones and Teeth
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Author:
Date:
2017-04-05
[Abstract] We have developed methods for isolating proteoglycans and glycosaminoglycans from archaeological bones and teeth. These methods have been previously published (Coulson-Thomas et al., 2015) and are described here in more detail. In the case of glycosaminoglycans, the method was a previously described method (Nader et al., 1999) which we optimized for archeological samples.
[摘要] 我们开发了从考古学骨骼和牙齿中分离蛋白聚糖和糖胺聚糖的方法。 以前已经公开了这些方法（Coulson-Thomas等人，2015），并且在这里更详细地描述。 在糖胺聚糖的情况下，该方法是先前描述的方法（Nader等人，1999），其针对考古样品进行了优化。
【背景】骨组织主要由矿物成分（羟基磷灰石）和由胶原，非胶原蛋白和蛋白聚糖（PG）组成的有机基质组成。 由于与羟基磷灰石紧密结合，细胞外基质蛋白和PG被保护免受死亡后温度和化学药剂的破坏作用。 然而，到目前为止，只有DNA和蛋白质已经从考古学骨骼中成功提取，因此我们开发了从考古学骨骼和牙齿中分离PG和糖胺聚糖（GAG）链的方法。 PGs和GAG在骨形态发生，体内平衡和退行性骨病中起主要作用，从考古骨骼分析这些分子将揭示有价值的古生物学信息。
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| Protein Expression Protocol for an Adenylate Cyclase Anchored by a Vibrio Quorum Sensing Receptor
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Author:
Date:
2017-01-20
[Abstract] The direct regulation of a mycobacterial adenylate cyclase (Rv1625c) via exchange of its membrane anchor by the quorum sensing receptor CqsS (Vibrio harveyi) has recently been reported (Beltz et al., 2016). This protocol describes the expression and membrane preparation for these chimeric proteins.
[摘要] 最近报道了通过其群岛感应受体CqsS（Vibrio harveyi）交换其膜锚定点直接调节分枝杆菌腺苷酸环化酶（Rv1625c）（Beltz等，2016）。 该方案描述了这些嵌合蛋白的表达和膜制备。
【背景】膜分隔的哺乳动物腺苷酸环化酶（AC）是IIIa类AC。调节是间接通过第一信使细胞外刺激G蛋白偶联受体（GPCR）而在细胞内释放的刺激（或抑制性）Gα-蛋白。 AC产生使用ATP作为底物的通用第二信使cAMP。脊椎动物AC中两个六角膜结构域的大小远远超过了对简单膜锚固的要求。然而，这种内在的膜锚定/受体结构域的调节特征是未知的。为了研究潜在的功能，选择了可以容易地在细菌中表达的分类细菌的典型类IIIa AC Rv1625c（Guo等人，2001和2005）与哺乳动物AC同工型相反。我们用来自哈维氏弧菌CqsS的六价体积感知（QS）受体的受体结构域取代了Rv1625c AC的六角膜锚，以检查我们是否可以通过QS配体的霍乱自动诱导剂直接调节AC -1'，CAI-1。 QS受体和IIIa类膜锚的设计是非常相似的，即最小的跨膜α-螺旋和极短的连接环。
我们已经证明了通过细胞外信号直接调节IIIa ...
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